①热图部分探讨的是两两变量间的相关性。横/纵坐标为17个变量(本图中的变量即为理化性质),例如第2行表示了温度(Temperature)与这17个变量的相关性大小,其中发现温度和溶解氧(Oxygen)的负相关性很强(方块大、颜色深蓝)
②颜色越蓝,代表负相关性越强;颜色越红,代表正相关性越强。Spearman(斯皮尔曼)相关系数是一种用于衡量两个变量之间非线性关系的统计指标
③方块的大小和颜色代表相关性大小
④左边的连线部分探讨的是3个矩阵与这17个变量的关联。这3个矩阵分别是分类群落(16S OTUS 和mOTUs是两种不同的操作分类单元,前者是以16S HRA基因标签来分类的,后者是以宏基因组)和功能群落。变量与矩阵之间连线,表明变量与相应矩阵之间存在关联
⑤图例说明
- 线的颜色与p值有关,绿色代表p<0.001,即矩阵间几乎不存在关联性
- 经过距离相关性的Mantel’sr统计,线越粗说明相关性越强
案例解读
温度和溶解氧在表层分类组成和功能组成中相关性最强,而盐度相关性不显著。在去除一些温度极低的极端区域后,养分(与微生物数据)之间只有微弱的相关性,且除了硅酸盐之外,(其余指标)相关性在统计上没有显著性。
03
Spearman和Pearson的异同?Mantel test是什么?
解答一
Spearman和Pearson相关系数都是用来衡量两个变量之间相关性的统计工具,但它们在计算方法和适用场景上有所不同。
Pearson相关系数:①用于衡量两个连续变量之间的线性相关性;②计算基于变量之间的差异程度和协方差:③假设数据是正态分布的。
Spearman相关系数:①用于衡量两个变量之间的单调相关性,不一定是线性的;②计算基于变量值的等级(排名):③不受数据分布形态的限制。
简而言之,Pearson适用于测量线性关系且数据正态分布,而Spearman适用于测量任何类型的单调关系,对数据分布没有要求。
解答二
Mantel test(Mantel检验)是一种在生态学、地理学、环境科学等领域中常用的统计方法,用于检验两组距离矩阵之间的相关性。这种检验经常用于比较生物群落之间的相似性(例如,基于物种组成)与地理距离或环境距离之间的相关性。
04
两个变量存在强相关,说明两个变量之间有因果关系吗?
相关不等于因果。即使两个变量之间存在强相关,也不能直接推断出一个变量是另一个变量变化的原因。
05
没有线性相关就说明没有关系吗?
在探讨变量关系时,线性相关是常见视角但非唯一。Pearson相关系数评估正态分布的线性关系,而Spearman相关系数适用于非正态分布的线性关系。相关系数0.1不代表无相关性,仅表明线性相关性不明显。变量间关系复杂,可能存在曲线相关。现实中,许多现象呈现非线性特征。因此,评估变量相关性需综合考虑多种可能性。
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